IF3211 Komputasi Domain-Spesifik - Catatan UAS (Benar/Salah)

Format Cepat-Baca

Setiap fakta adalah pernyataan BENAR dari slide. Jika soal ujian bertentangan dengan fakta ini → SALAH.

Bab 7 - Respirasi Seluler & Fermentasi

Persamaan Inti

• Keseluruhan: C₆H₁₂O₆ + 6O₂ → 6CO₂ + 6H₂O + Energi (ATP + panas)
• Respirasi aerob memerlukan oksigen; fermentasi TIDAK menggunakan oksigen

3 Tahap (secara berurutan)

Fakta Kunci - Respirasi

• Glikolisis = 2 ATP neto (fosforilasi tingkat substrat); berlangsung di sitosol
• Sintesis DNA TIDAK terjadi dalam glikolisis; glukosa → 2 piruvat
• Oksidasi = pelepasan elektron; Reduksi = penerimaan elektron (OIL RIG)
• Akseptor elektron terakhir dalam respirasi aerob = O₂
• Hasil ATP yang pasti tidak dapat ditentukan karena fosforilasi tidak terikat langsung pada reaksi redoks
• Hasil ATP juga bervariasi tergantung apakah elektron dibawa oleh NAD⁺ atau FAD
• Efisiensi keseluruhan respirasi seluler ≈ 34% (sisanya hilang sebagai panas)
• Glikolisis kemungkinan berevolusi lebih awal; berlangsung di sitosol (sebelum mitokondria ada)

Fermentasi

• Fermentasi = glikolisis + reaksi yang meregenerasi NAD⁺ (agar glikolisis dapat berlanjut)
• NAD⁺ diregenerasi melalui transfer elektron dari NADH ke piruvat atau turunannya
• Fermentasi TIDAK menggunakan rantai transpor elektron (RTE)
• Respirasi anaerob MENGGUNAKAN RTE (tetapi dengan akseptor elektron akhir yang berbeda, mis. SO₄²⁻)
• Fermentasi alkohol: piruvat → asetaldehid (melepas CO₂) → etanol; meregenerasi NAD⁺; digunakan dalam pembuatan bir, anggur, roti (khamir/ragi)
• Fermentasi asam laktat: piruvat → laktat secara langsung; TIDAK melepas CO₂; digunakan untuk keju, yogurt
• Serat otot putih manusia dapat menghasilkan laktat bahkan dalam kondisi aerob (cepat tetapi tidak efisien)
• Fermentasi asam laktat oleh jamur/bakteri digunakan untuk membuat keju dan yogurt

Hands-On M7 - Komputasi Respirasi Seluler

ATP_PER_NADH, ATP_PER_FADH2 = 2.5, 1.5          # modern P/O ratio

total_nadh  = 2 + 2 + 6   # glikolisis + oks-piruvat + krebs (×2 putaran)
total_fadh2 = 2            # krebs saja
atp_substrate = 4          # glikolisis (2) + krebs substrate-level (2)
total_atp = atp_substrate + total_nadh * ATP_PER_NADH + total_fadh2 * ATP_PER_FADH2
# = 4 + 25.0 + 3.0 = 32.0 ATP per glukosa

def hitung_atp_fatty_acid(chain_len, n_betaox, n_acetylCoA):
    atp_bo    = n_betaox * (ATP_PER_NADH + ATP_PER_FADH2)        # per siklus
    atp_krebs = n_acetylCoA * (1 + 3*ATP_PER_NADH + ATP_PER_FADH2)  # 10 per asetil-CoA
    return atp_bo + atp_krebs - 2    # −2 biaya aktivasi (ATP ekuivalen)
# Contoh C16: n_betaox=7, n_acetylCoA=8 → 106.0 ATP total (6.625 ATP/karbon vs 5.33 glukosa)

inhibitors = {
    'Oligomisin':      {'target': 'ATP Synthase',         'blocks': 'FosOks'},
    'Rotenon':         {'target': 'Kompleks I (NADH-DH)', 'blocks': 'FosOks'},
    'DNP (uncoupler)': {'target': 'Membran gradien H⁺',  'blocks': 'FosOks'},
}
blocked_atp = atp_ox_total * (red_pct / 100)
atp_with_inhibitor = total_atp - blocked_atp

Bab 9 - Siklus Sel

Fase Siklus Sel

• Siklus sel = kehidupan sel sejak terbentuk hingga pembelahannya sendiri
• Dua fase utama: Interfase (~90%) dan Fase Mitotik (Fase M)
• Interfase = G₁ (“celah pertama”) → S (“sintesis”) → G₂ (“celah kedua”)
• Kromosom diduplikasi hanya pada fase S
• G₁ = sel tumbuh; G₂ = sel mempersiapkan pembelahan; S = replikasi DNA

Fase Mitosis (secara berurutan)

1. Profase - kromosom memadat; gelendong mulai terbentuk
2. Prometafase - selubung nukleus hancur; mikrotubulus kinetokor melekat
3. Metafase - sentromer berbaris di lempeng metafase (titik tengah antara dua kutub)
4. Anafase - kromatid saudara terpisah; bergerak ke kutub berlawanan
5. Telofase - selubung nukleus terbentuk kembali; kromosom mengendur

Gelendong Mitotik

• Gelendong mitotik = mikrotubulus + protein terkait; mengendalikan pergerakan kromosom
• Pada sel hewan, mikrotubulus gelendong dirakit dari sentrosom (pusat pengorganisasian mikrotubulus)
• Sentrosom diduplikasi saat interfase; dua sentrosom bermigrasi ke kutub berlawanan saat profase/prometafase
• Aster = susunan radial mikrotubulus pendek yang memanjang dari setiap sentrosom
• Kinetokor = kompleks protein di sentromer; melekat pada mikrotubulus kinetokor saat prometafase
• Lempeng metafase = struktur imajiner di titik tengah antara dua kutub gelendong
• Pada anafase: kromatid saudara terpisah; mikrotubulus memendek dengan depolimerisasi di ujung kinetokor
• Mikrotubulus nonkinetokor dari kutub berlawanan saling tumpang tindih dan mendorong satu sama lain, memanjangkan sel

Sitokinesis

• Sel hewan: sitokinesis melalui pembelahan (cleavage) → membentuk lekukan pembelahan (cincin kontraktil mikrofilamen)
• Sel tumbuhan: lempeng sel terbentuk saat sitokinesis (BUKAN lekukan pembelahan)
• Sitokinesis dimulai saat anafase atau telofase

Prokariota vs Eukariota

• Prokariota bereproduksi melalui pembelahan biner (bukan mitosis)
• Pembelahan biner: kromosom bereplikasi dari titik asal replikasi; membran plasma mencubit ke dalam
• Mitosis kemungkinan berevolusi dari pembelahan biner
• Sel somatik manusia (sel tubuh, bukan reproduktif) = 46 kromosom (2 set masing-masing 23)
• Gamet manusia (sperma, sel telur) = 23 kromosom (setengah dari sel somatik)
• Kromosom eukariotik = kromatin (DNA + protein)

Kontrol Siklus Sel & Kanker

• Siklus sel dikendalikan oleh pos pemeriksaan (checkpoint): pos G₁, G₂, dan M
• Pos G₁ = paling penting; disebut titik restriksi pada sel mamalia
• Jika tidak ada sinyal lanjut di G₁ → sel keluar ke G₀ (keadaan tidak membelah)
• Jika ada sinyal lanjut di G₁ → sel biasanya menyelesaikan S, G₂, M, dan membelah
• Sel kanker TIDAK merespons sinyal yang biasanya mengatur siklus sel
• Sel kanker TIDAK memerlukan faktor pertumbuhan untuk tumbuh dan membelah
• Sel yang membelah tanpa batas dalam kultur telah mengalami transformasi
• Tumor jinak: tetap di tempat asal
• Tumor ganas: menyerang jaringan sekitar; mengalami metastasis (menyebar ke bagian tubuh lain)
• Tumor terlokalisasi: diobati dengan radiasi; tumor metastatik: diobati dengan kemoterapi
• Efek samping kemoterapi karena obat juga memengaruhi sel normal yang sering membelah

Hands-On M8 - Komputasi Siklus Sel

def proporsi_fase(durations):
    total = sum(durations.values())
    return {fase: dur / total for fase, dur in durations.items()}
# Misal {G1:11, S:8, G2:4, M:2} → G1=44%, S=32%, G2=16%, M=8%

def simulasi_populasi(initial_cells, cycle_hours, growth_factor, observation_hours):
    waktu, sel = [0], [initial_cells]
    t, n = 0, initial_cells
    while t + cycle_hours <= observation_hours:
        t += cycle_hours
        n *= growth_factor
        waktu.append(t)
        sel.append(n)
    return waktu, sel
# g=1.9 per siklus, cycle=25h, obs=72h → 2 siklus selesai

def checkpoint_delay(durations, checkpoint_type):
    perturbed = durations.copy()
    delays = {'g1_delay': ('G1', 2), 's_delay': ('S', 2),
              'g2_delay': ('G2', 2), 'm_delay': ('M', 1)}
    if checkpoint_type in delays:
        fase, dt = delays[checkpoint_type]
        perturbed[fase] += dt
    return perturbed
# Delay memperpanjang siklus → laju pertumbuhan populasi menurun

Bab 19 - Evolusi: Penurunan dengan Modifikasi

Darwin & Sejarah

• Darwin menerbitkan On the Origin of Species pada 1859
• Pelayaran Darwin: HMS Beagle, Desember 1831 – Oktober 1836
• Alfred Russel Wallace secara independen mengembangkan teori serupa; dipresentasikan bersama Juli 1858
• Variasi paruh burung finch di Kepulauan Galápagos = bukti yang diamati Darwin
• Evolusi = “penurunan dengan modifikasi” (descent with modification)
• “Penurunan” = leluhur bersama; “Modifikasi” = akumulasi perbedaan antarGenerasi
• Georges Cuvier mengembangkan paleontologi; fosil ditemukan di lapisan batuan sedimen (lebih muda = atas)
• Lamarck mengusulkan penggunaan/tidak-penggunaan + pewarisan sifat yang diperoleh - TIDAK didukung

Seleksi Alam

• Seleksi alam: individu dengan sifat herediter yang menguntungkan bertahan hidup dan bereproduksi lebih banyak
• Populasi (BUKAN individu) yang berevolusi
• Seleksi alam hanya bekerja pada sifat herediter yang berbeda antar individu
• Seleksi alam TIDAK menciptakan sifat baru - memilih dari variasi herediter yang sudah ada
• Sifat yang adaptif bervariasi menurut tempat dan waktu
• Evolusi terjadi lebih cepat pada spesies dengan waktu generasi singkat
• Seleksi buatan: pemuliaan selektif untuk sifat yang diinginkan (mis. sawi liar → brokoli, kol, kale)

4 Jenis Bukti Evolusi

1. Pengamatan langsung (mis. resistensi antibiotik MRSA)
2. Homologi (kemiripan dari leluhur bersama)
3. Catatan fosil
4. Biogeografi

Kasus Kunci

• MRSA: S. aureus menjadi resisten terhadap penisilin dalam 2 tahun penggunaan luas (pada 1945); lalu resistensi metisillin juga berevolusi dalam 2 tahun
• Transisi fosil (evolusi paus): Pakicetus → Rodhocetus → Dorudon → Cetacea modern
• Homologi ≠ Analogi: Homologi = berasal dari leluhur bersama; Analogi = evolusi konvergen
• Evolusi konvergen (fitur analogis): sugar glider vs. tupai terbang - BUKAN bukti leluhur bersama
• Biogeografi = ilmu tentang distribusi geografis spesies

Hands-On M11 - Komputasi Evolusi Populasi

def next_p(p, w11, w12, w22):
    q    = 1 - p
    wbar = p**2*w11 + 2*p*q*w12 + q**2*w22
    return (p**2*w11 + p*q*w12) / wbar   # rekursif satu generasi

def wf_step(p, N, w11, w12, w22, rng):
    p_sel = next_p(p, w11, w12, w22)     # koreksi seleksi dulu
    k     = rng.binomial(2*N, p_sel)     # sampling stokastik (2N alel)
    return k / (2*N)

# R=50 ulangan, iterasi G generasi
trajs = np.empty((R, G+1))
for r in range(R):
    trajs[r, 0] = p0
    for t in range(G):
        trajs[r, t+1] = wf_step(trajs[r, t], N, w11, w12, w22, rng)

fixation_pr   = np.mean(trajs[:, -1] == 1.0)   # Pr(alel A terfiksasi)
extinction_pr = np.mean(trajs[:, -1] == 0.0)   # Pr(alel A punah)

Bab 20 - Filogeni dan Pohon Kehidupan

Klasifikasi

• Filogeni = sejarah evolusi suatu spesies atau kelompok
• Sistematika = mengklasifikasikan organisme DAN menentukan hubungan evolusioner
• Taksonomi = pembagian dan penamaan organisme secara teratur
• Nomenklatur binomial: diperkenalkan oleh Carolus Linnaeus (abad ke-18)
• Format: Genus (huruf kapital) + epitet spesifik (huruf kecil); seluruh nama dicetak miring
• Kedua bagian bersama-sama menamai spesies (BUKAN hanya epitet spesifik saja)

Hierarki Taksonomi (PALING TIDAK inklusif → PALING inklusif)

Spesies → Genus → Famili → Ordo → Kelas → Filum → Kingdom → Domain

Mnemonik: “Saya Guru Favorit Orang Kelas Filum Kingdom Dunia”

• Contoh: Macan tutul = Panthera pardus; Famili Felidae; Ordo Carnivora; Kelas Mammalia; Filum Chordata; Kingdom Animalia; Domain Eukarya
• Takson (jamak: taksa) = unit taksonomi yang diberi nama pada tingkatan mana pun
• 3 Domain: Bacteria, Archaea, Eukarya

Pohon Filogenetik

• Pohon filogenetik = diagram percabangan yang merepresentasikan hipotesis evolusioner
• Titik percabangan = divergensi dua silsilah dari leluhur bersama
• Taksa saudara = kelompok yang berbagi leluhur bersama secara langsung
• Cabang DAPAT dirotasi tanpa mengubah hubungan yang digambarkan
• Pohon dapat digambar secara horizontal, vertikal, atau diagonal - hubungan tidak berubah
• Simpul/cabang internal tanpa label dapat merepresentasikan kelompok yang telah punah
• Hanya homologi (BUKAN analogi) yang dapat digunakan untuk menyimpulkan hubungan filogenetik
• Analogi = kemiripan dari evolusi konvergen → TIDAK menunjukkan leluhur bersama

Hands-On M12 - Komputasi Filogeni

def hamming_from_character_table(df):
    taxa = list(df.index)
    dist = {a: {b: int((df.loc[a] != df.loc[b]).sum()) for b in taxa} for a in taxa}
    return dist
# Takson dengan jarak terkecil = kandidat sister taxa

def pairwise_seq_distance(seqs):
    taxa = list(seqs.keys())
    dist = {a: {b: sum(x != y for x, y in zip(seqs[a], seqs[b])) for b in taxa} for a in taxa}
    return dist

def upgma(distance_df):
    # Greedy: gabungkan dua kluster titerdekat, perbarui jarak (rata-rata)
    # Tinggi cabang = jarak_minimum / 2
    # Output: Newick string, misal "(Lancelet:0.50,(Lamprey:0.25,Bass:0.25):0.25);"
    clusters = {name: [name] for name in distance_df.index}
    while len(clusters) > 1:
        a, b = min(((i,j) for i in clusters for j in clusters if i<j),
                   key=lambda p: distance_df.loc[p[0], p[1]])
        new_h = distance_df.loc[a, b] / 2
        # update jarak ke kluster baru = rata-rata tertimbang
        clusters[a+'+'+b] = clusters.pop(a) + clusters.pop(b)
    # return Newick string

Bab 41 - Komunitas Ekologi

Interaksi Antarspesies

Kompetisi

• Prinsip eksklusi kompetitif: dua spesies yang bersaing untuk sumber daya pembatas yang sama tidak dapat hidup berdampingan secara permanen
• Contoh klasik: Paramecium aurelia menyebabkan kepunahan P. caudatum saat dibiakkan bersama
• Relung ekologi = kumpulan spesifik sumber daya biotik dan abiotik yang digunakan organisme
• Pemisahan sumber daya = diferensiasi relung yang memungkinkan hidup berdampingan
• Pergeseran karakter = perbedaan karakter lebih besar ketika spesies bersifat simpatrik (wilayah sama) daripada alopatrik (wilayah berbeda)

Pertahanan terhadap Predasi

• Pewarnaan kriptik = kamuflase (menyatu dengan latar belakang)
• Pewarnaan aposematik = warna peringatan mencolok (menandakan ketoksikan)
• Mimikri Batesian = spesies tidak berbahaya meniru penampilan spesies berbahaya

Parasitisme

• Endoparasit: hidup di dalam inang
• Ektoparasit: hidup di luar inang

Keanekaragaman Spesies & Struktur Komunitas

• Keanekaragaman spesies = kekayaan spesies + kelimpahan relatif
• Kekayaan spesies = jumlah spesies berbeda dalam komunitas
• Kelimpahan relatif = proporsi yang diwakili setiap spesies dari seluruh individu
• Indeks keanekaragaman Shannon: H = −(p_A ln p_A + p_B ln p_B + …)
• Struktur tropik: hubungan makan; rantai makanan menghubungkan dari produsen hingga karnivora puncak
• Jaring-jaring makanan = rantai makanan yang saling terhubung dengan interaksi tropik kompleks
• Spesies fondasi: pengaruh kuat pada komunitas karena ukuran besar atau kelimpahan tinggi
• Spesies kunci: pengendalian komunitas yang kuat melalui peran ekologi yang kritis (TIDAK harus berlimpah)
• Insinyur ekosistem: menyebabkan perubahan fisik pada lingkungan (mis. berang-berang membangun bendungan)
• Model bawah-atas (bottom-up): pasokan nutrien/tingkat tropik bawah membatasi kelimpahan di tingkat atas
• Model atas-bawah (top-down): predasi mengendalikan organisasi komunitas (predator membatasi herbivora yang membatasi produsen)
• Biomanipulasi = penerapan model atas-bawah untuk meningkatkan kualitas air danau yang tercemar

Gangguan & Suksesi

• Gangguan = peristiwa yang mengubah komunitas dengan menyingkirkan organisme atau mengubah ketersediaan sumber daya
• Hipotesis gangguan menengah: gangguan sedang mendorong keanekaragaman spesies yang terbesar
• Gangguan tinggi → menyingkirkan spesies tumbuh lambat; Gangguan rendah → dominan kompetitif menyingkirkan yang lain
• Suksesi ekologi = perubahan bertahap komposisi komunitas setelah gangguan besar
• Suksesi primer: dimulai di daerah yang hampir tidak bernyawa (pulau vulkanik, mundurnya gletser)
• Suksesi sekunder: dimulai di mana gangguan menyingkirkan sebagian besar tetapi TIDAK semua organisme (mis. setelah kebakaran)
• Aktivitas manusia = gangguan terkuat pada ekosistem; umumnya mengurangi keanekaragaman spesies

Hands-On M13 - Komputasi Ekologi Komunitas

def lotka_volterra(state, t, r, K, alpha, beta, gamma):
    x, y = state              # x=prey, y=predator
    dxdt = r*x*(1 - x/K) - alpha*x*y
    dydt = beta*x*y - gamma*y
    return [dxdt, dydt]
# Ekuilibrium: x*=γ/β, y*=r(1−x*/K)/α
# sol = odeint(lotka_volterra, [200, 20], t, args=(0.4, 1000, 0.04, 0.005, 0.3))

def shannon_diversity(counts):
    p = np.array(counts, dtype=float); p = p[p > 0] / p.sum()
    return -np.sum(p * np.log(p))

def species_evenness(H, S):
    return H / np.log(S) if S > 1 else 0.0   # J ∈ [0,1]

# Food web - connectance
G = nx.DiGraph(); G.add_edges_from(food_web_edges)
C = G.number_of_edges() / G.number_of_nodes()**2   # C = E/N²

# Species-Area Curve (log-log regresi)
slope, intercept, r2, p = linregress(np.log10(A), np.log10(S))
# log(S) = intercept + slope × log(A);  slope = z (tipikal 0.20–0.35)

Bab 42 - Ekosistem dan Energi

Dasar-dasar Ekosistem

• Ekosistem = semua organisme dalam suatu komunitas + faktor abiotik yang berinteraksi dengannya
• Dua sifat emergent utama: aliran energi + daur kimia
• Energi MENGALIR melalui ekosistem (tidak didaur ulang); bahan kimia BERDAUR dalam ekosistem
• Hukum termodinamika ke-1: energi tidak dapat diciptakan atau dimusnahkan - hanya dipindahkan/ditransformasi
• Hukum termodinamika ke-2: setiap pertukaran energi meningkatkan entropi; sebagian energi selalu hilang sebagai panas
• Hukum kekekalan massa: materi tidak dapat diciptakan/dimusnahkan; unsur kimia DAPAT didaur ulang

Produksi Primer

• ~1% cahaya tampak yang mengenai organisme fotosintetik diubah menjadi energi kimia
• PPK / GPP (Gross Primary Production = Produksi Primer Kasar) = total produksi primer
• PPB / NPP (Net Primary Production = Produksi Primer Bersih) = PPK − respirasi autotrof = biomasa baru yang ditambahkan
• PEB / NEP (Net Ecosystem Production = Produksi Ekosistem Bersih) = laju akumulasi biomasa total
• PEB > 0 → rosot karbon (memperoleh lebih banyak karbon daripada yang dilepaskan)
• PEB < 0 → sumber karbon (melepaskan lebih banyak karbon daripada yang diperoleh)
• Perubahan iklim dapat menyebabkan ekosistem beralih dari rosot karbon menjadi sumber karbon

Tingkatan Tropik & Transfer Energi

• Efisiensi tropik ≈ 10% produksi dipindahkan dari satu tingkat tropik ke tingkat berikutnya
• Contoh piramida: 1.000.000 J sinar matahari → 10.000 J produsen → 1.000 J konsumen primer → 100 J sekunder → 10 J tersier
• Produksi sekunder = energi kimia dalam makanan yang diubah menjadi biomasa baru
• Efisiensi produksi = produksi sekunder bersih / asimilasi produksi primer × 100%
• Asimilasi = total energi yang dikonsumsi dan digunakan untuk pertumbuhan, reproduksi, DAN respirasi

Nutrien Pembatas

• Nutrien pembatas = unsur yang, jika ditambahkan, meningkatkan produksi
• Laut: nitrogen (N) dan fosfor (P) paling sering membatasi produksi; besi (Fe) juga membatasi di beberapa wilayah (mis. Laut Sargasso - penambahan N + P + Fe meningkatkan produksi 12×)
• Daratan: nitrogen membatasi pertumbuhan tanaman paling besar secara global; fosfor juga dapat membatasi (terutama tanah tua)
• Penambahan nutrien pembatas hanya meningkatkan produksi sampai nutrien lain menjadi pembatas
• Penetrasi cahaya di akuatik: setengah radiasi matahari diserap dalam 15 m pertama; hanya 5–10% yang mencapai 75 m
• Eutrofikasi = peningkatan dramatis produksi primer akibat kelebihan nutrien dalam ekosistem akuatik

Daur Nutrien & Dekomposisi

• Daur nutrien = siklus biogeokimia (melibatkan komponen biotik dan abiotik)
• Siklus biogeokimia dapat bersifat global atau lokal
• Pertumbuhan pengurai dikendalikan oleh suhu, kelembapan, dan ketersediaan nutrien
• Laju dekomposisi lebih cepat di ekosistem yang lebih hangat
• Hutan Eksperimental Hubbard Brook: kehilangan nutrien jauh lebih besar di lahan yang ditebang dibanding hutan utuh
• Tumbuhan mengendalikan jumlah nutrien yang meninggalkan ekosistem hutan utuh
• Bioremediasi = penggunaan organisme (prokariota, jamur, tumbuhan) untuk mendetoksifikasi ekosistem tercemar
• Augmentasi biologis = penggunaan organisme untuk menambahkan bahan esensial ke ekosistem yang terdegradasi (mis. lupin pengikat nitrogen untuk menambah N; simbiont mikoriza untuk meningkatkan akses nutrien)

Hands-On M14 - Komputasi Ekosistem

# Piramida energi: transfer antar level trofik
npp_kJ   = npp_g * 20             # 1 g dry mass ≈ 20 kJ
eff      = eff_pct / 100          # misal 0.10 (10%)
energies = [npp_kJ * eff**i for i in range(n_levels)]
# Contoh Temperate Grassland (NPP=600 g): 12000 → 1200 → 120 kJ

# Perbandingan NPP (data Campbell Bab 55)
df_npp = pd.DataFrame(EKOSISTEM_LIST, columns=["Ekosistem", "NPP (g/m²/yr)"])
df_npp = df_npp.sort_values("NPP (g/m²/yr)", ascending=True)

# Analisis Salt Marsh Teal (1962)
solar, GPP_grass, NPP_grass = 600000, 34580, 6585
GPP_ins, detritus           = 305, 3671
pct_GPP      = GPP_grass / solar * 100          # 5.76% - efisiensi fotosintesis
pct_NPP      = NPP_grass / solar * 100          # 1.10%
resp_grass   = GPP_grass - NPP_grass            # 27995 kcal - respirasi produsen
pct_detritus = detritus / NPP_grass * 100       # 55.7% NPP masuk jalur detritivor
eff_trophic  = GPP_ins / GPP_grass * 100        # 0.88% transfer rumput → serangga

Jebakan Benar/Salah Berisiko Tinggi

Glosarium